La regione di Johto è una vasta area situata ad ovest di Kanto. A differenza di Kanto il suo nome non è direttamente basato su quello di una regione del Giappone, ma significa "palazzo del castello" o "reticolo a forma di palazzo"; in questo senso è collegato alla città di Nara, che è stata la base per  Violapoli (Violet City). Johto è stato esplorato inizialmente nei giochi di II generazione, dov'è sede di di 100 nuovi pokémon che non erano presenti nei giochi precedenti. Nei giochi di II e nel remake di IV generazione i giocatori iniziano il loro viaggio a Borgo Foglianova (New Bark Town), dove il professor Elm offre loro la scelta tra Chikorita, Cyndaquil o Totodile come loro starter. I nomi delle città di Johto sono legati per lo più alle piante. Le palestre di Johto hanno la caratteristica di non ripetere i tipi di quelle di quelle precedenti (semplicemente perche nei giochi sono da sconfiggere anche i capipalestra di Kanto).
NOTE: Le generazioni in questa pagina si basano sui giochi in cui è esplorabile Johto e quindi...
II generazione Oro/Argento/Cristallo,
IV generazione HeartGold/SoulSilver

MEDAGLIA: Zefiro (Potenzia l’attacco di tutti i pokemon, potete usare Flash fuori dalla lotta).
CARTELLO: L'elegante maestro di pokemon di tipo volante.
POKEMON USATI: Pidgey, Pidgeotto
PREMI: TM 31 (Fangosberla) nella II generazione, TM 51 (Trespolo) nella IV generazione
DESCRIZIONE: Valerio è il capopalestra di Violapoli ed è specializzato in pokemon di tipo volante. Utilizza in particolare pokémon di basso livello che si trovano in qualsiasi regione. Come tutti i capipalestra dei giochi di IV generazione Valerio si può trovare fuori della sua palestra di tanto in tanto. Una volta che il giocatore ha sconfitto i Superquattro lo si può incontrare ad Azzurropoli mentre parla con la collega Nina (Fucsiapoli), al quarto piano dei grandi magazzini. Scambiati i numeri del Pokegear Valerio si recherà al Fighting Dojodi Zafferanopoli ogni sabato mattina ad accettare un nuovo incontro con una squadra di Pokémon più forte.

MEDAGLIA: Alveare (Tutti i pokemon fino al Lv 30 ti obbediranno. Potete usare Taglio fuori dalla lotta).
CARTELLO: L'’enciclopedia vivente dei pokemon coleottero.
POKEMON USATI: Scyther, Metapod, Kakuna.
PREMI: MT 49 (Tagliofuria ) nella II generazione, TM 89 (Retromarcia) nella IV generazione.
DESCRIZIONE: Raffaello è il capopalestra di Azalina ed è specializzato in pokemon coleottero. La sua è la seconda palestra della regione ma non può essere sfidato prima di aver cacciato il team Rocket dal pozzo Slowpoke. Grazie alla sua ricerca sui pokemon coleottero, ha una conoscenza tale da renderlo una autorità su di loro. Raffaello sostiene di non perdere mai quando si tratta di pokemon coleottero, ma una volta sconfitto dal giocatore ammetterà che la sua ricerca non è ancora finita. Potrà essere risfidato in quanto ogni giovedi viaggia per il bosco Smeraldo, dove consegnerà il suo numero di telefono intorno a mezzogiorno. Nel pomeriggio lo si troverà al Fighting Doj odi Zafferanopoli pronto ad accettare una rivincita con una squadra più forte.

MEDAGLIA: Piana (Potrete usare Forza anche fuori dalla lotta).
CARTELLO: Carina,troppo carina!
POKEMON USATI: Clefairy, Miltank.
PREMI: MT 24 (Fulmine) nella I generazione, TM 34 (Onda Shok) nella III e IV generazione.
DESCRIZIONE: Chiara è la capopalestra di Fiordoropoli e utilizza graziosi pokemon di tipo normale. Anche se giovanissima il suo talento ha attirato l'interesse della lega pokemon che l'ha scelta come capopalestra ufficiale di Johto. La sua palestra è piena di altre ragazze che come lei fanno uso di pokémon di tipo normale. Nei giochi di IV generazione Chiara è inizialmente assente dalla palestra ma la si può trovare nella torre radio mentre tenta di vincere alla lotteria. Se il giocatore la aiuta tornerà in palestra. Nonostante questo atto di gentilezza dopo sconfitta avrà uno scatto d'ira e si rifiuterà di consegnare la medaglia ma si calmerà presto e vi darà i premi meritati.Chiara può essere risfidata andando sulla strada per i grandi magazzini fi Fiordoropoli (a differenza di altri capipalestra non si recherà lontano) di sabato durante il giorno. Una volta che il suo numero di telefono PokéGear è stato ottenuto, accetterà l'incontro di sabato pomeriggio presso il Fighting Dojo di Zafferanopoli. La sua squadra in queste battaglie sarà significativamente più forte.

MEDAGLIA: Nebbia (Tutti i pokemon fino al Lv 50 ti obbediranno. Potete usare Surf fuori dalla lotta).
CARTELLO: Il magico veggente
POKEMON USATI: Gastly, Haunter, Haunter, Gengar.
PREMI: MT 30 (Palla Ombra)
DESCRIZIONE: Angelo è il capopalestra di Amarantopoli e utilizza pokemon di tipo spettro. La sua palestra è costituita da un pozzo buio in cui gli allenatori sembrano fluttuare ma che in realtà sono sorretti da un pavimento invisibile. Il giocatore deve percorrere tale percorso sfidando tutti gli allenatori fino ad arrivare al capopalestra. In pokemon Cristallo Angelo si unisce ad Eugenio per studiare alla torre bruciata le antiche leggende sui tre cani leggendari. Nei giochi di IV generazione lo si può trovare  nel giardino della torre di latta e dopo aver ottenuto il suo numero si potrà essere richiamati di martedi notte per organizzare un nuovo incontro.
 

MEDAGLIA: Tempesta (Tutti i pokemon fino al Lv 70 ti obbediranno, puoi usare Volo fuori dalla lotta).
CARTELLO: I pugni roboanti parlano per lui
POKEMON USATI: Primeape, Poliwrath.
PREMI: MT 01 (Dinamipugno) nella II generazione, MT 01 (Centripugno) nella IV generazione.
DESCRIZIONE: Furio è il capopalestra di Fiorlisopoli e usa pokemon di tipo lotta. Ha una moglie con cui non passa molto tempo e lei, non molto contenta di questo, aspetta il marito fuori dalla palestra in attesa che torni a casa (è lei a dare al giocatore la MN Volo). La palestra di Furio della IV generazione è molto diversa rispetto a quella della II. Nei giochi di II generazione il capopalestra prima della battaglia cerca di intimidire l'avversario sollevando e lanciando un masso. Nella IV generazione Furio attende il giocaore sotto una grossa cascata  e non si accorge dell'avversario finche il flusso d'acqua sotto il quale sta meditando non si interrompe. Furio è l'unico capopalestra che una volta battuto non viaggia per la regione. Il suo numero di Pokegear potrà comunque essere ricevuto dalla moglie e se il giocatore lo chiama di mercoledi notte, si recherà a Zafferanopoli per una rivincita.

MEDAGLIA: Minerale (Potenzia la difesa di tutti i pokemon).
CARTELLO: La ragazza con una difesa d’acciaio
POKEMON USATI: Magnemite, Magnemite, Steelix
PREMI: TM 23 (Codacciaio)
DESCRIZIONE: Jasmine è la capopalestra di Olivinopoli ed è specializzata in pokemon di tipo acciaio. E' una ragazza molto timida e compassionevole, quando il Ampharos (soprannominato Amphy), il pokemon che illumina il faro del porto cittadino, si ammala, è talmente preoccupata da non riuscire neppure a sorridere. Amphy è molto affezionato a Jasmine, infatti una volta che la medicina viene portata dal giocatore il pokemon la accetterà solo da lei. Solamente dopo aver curato Ampharos sarà possibile combattere contro Jasmine, che è la quinta capopalestra ad essere incontrata ma la sesta ad essere sfidata in quanto la medicina si trova a Fiorlisopoli, città di Furio. Jasmine potrà essere sfidata nuovamente a Zafferanopoli di mercoledi pomeriggio e dopo averla battuta vi proporrà di scambiare uno Steelix (soprannominato Neil) per un altro qualsiasi pokemon. Jasmine compare anche nei giochi Perla/Diamante/Platino nei quali dona al giocatore la MN Cascata. La si può trovare ad Arenipoli (città che le ricorda Olivinopoli per la presenza del faro) sulla piccola spiaggia e di tanto in tanto partecipa ai cotest col suo Steelix (soprannominato Rusty, in giapponese Neil).

MEDAGLIA: Gelo (Potenzia l’attacco speciale di tutti i tuoi pokemon, puoi usare Mulinello anche fuori dalla lotta).
CARTELLO: Il maestro del duro inverno.
POKEMON USATI: Seel, Dewgong, Piloswine.
PREMI: MT 16 (Ventogelato ) nella II generazione, MT 07 (Grandine) nella IV generazione.
DESCRIZIONE: Alfredo è il capopalestra di Mogania e usa pokemon di tipo ghiaccio. E' il più vecchio capopalestra di tutti i giochi, si allena da oltre 50 anni e usa gli stesi pokemon da prima che che il giocatore nascesse. Il capopalestra può essere sfidato solo dopo aver battuto il Team Rocket al lago d'Ira poichè la sua palestra è bloccata da un uomo. Dopo averlo battuto lo si potrà incontrare il sabato mattina al lago d'Ira e, dopo aver ottenuto il suo numero, lo si potrà risfidare di lunedi mattina.

MEDAGLIA: Levante (Tutti i pokemon ti obbediranno, puoi usare Cascata anche fuori dalla lotta).
CARTELLO: Con i pokemon drago è divina
POKEMON USATI: Dragonair, Dragonair, Dragonair, Kingdra (II generazione); Dragonair, Dragonair, Gyarados, Kingdra (IV generazione).
PREMI: MT 24 (Dragospiro) nella II generazione; MT 59 (Dragopulsar) nella IV generazione.
DESCRIZIONE: Sandra è la capopalestra di Ebanopoli e, come suo cugino Lance il campione di Johto, usa pokemon di tipo drago. E' sicura di se, tanto da definirsi "la miglior allenatrice di pokemon drago", e la sua unica sconfitta nota (oltre a quella col giocatore) è con il cugino Lance. Dopo la sconfitta si rifiuta di consegnare la medaglia al giocatore a meno che questi non dimostri la sua abilità trovando il santuario posto alla fine della Tana del drago. Dopo aver consegnato i meritati premi lo incita a superare con successo la lega pokemon, probabilmente per motivi puramente personali in quanto è in imbarazzo ad aver perso contro un ragazzino. Dopo che il giocatore è diventato campone la si incontra a volte nella Tana del drago per una sfida 2 contro 2 insieme a Lance (il giocatore invece combatterà con il rivale). Ottenuto qui il suo numero la si potrà risfidare a Zafferanopoli.